RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LIAS-222	ENST00000640888	SDS	P20132	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LIAS-222	ENST00000640888	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LIAS-222	ENST00000640888	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LIAS-222	ENST00000640888	PDE1A	P54750	535 aa		11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	MYD88	Q99836	296 aa		11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.5	5e-7	■■■■■ 27
LIAS-222	ENST00000640888	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.96	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	IL2RB	P14784	551 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RGS12	O14924	1447 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ERC2	O15083	957 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	SIL1	Q9H173	461 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ST18	O60284	1047 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PXDN	Q92626	1479 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	LTN1	O94822	1766 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	CYP27B1	O15528	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	GRM8	O00222	908 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	KCNJ4	P48050	445 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RABEP1	Q15276	862 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	AACS	Q86V21	672 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	SLIT3	O75094	1523 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LIAS-222	ENST00000640888		A0A087WZG4	1122 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	MEGF6	O75095	1541 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	ADCY9	O60503	1353 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	CPD	O75976	1380 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	EXOC5	O00471	708 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	NEK4	P51957	841 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	STARD3NL	O95772	234 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	A1BG	P04217	495 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GCKR	Q14397	625 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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