RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 ERC2O15083 957 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 ADCY9O60503 1353 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 CPDO75976 1380 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 KSR2Q6VAB6 950 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 PHKG2P15735 406 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 SRGAP3O43295 1099 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 DDIT3P35638 169 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-211ENST00000636934 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 MTX1Q13505 466 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 ZNF790Q6PG37 636 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 MEGF6O75095 1541 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 ANXA1P04083 346 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 MCM4P33991 863 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 DCAF5Q96JK2 942 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 MRC1P22897 1456 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 LINS1Q8NG48 757 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 ST18O60284 1047 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 MCCP23508 829 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 HSPA2P54652 639 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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CLN8-211ENST00000636934 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 PTMSP20962 102 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 CHRNA2Q15822 529 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
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CLN8-211ENST00000636934 IL27Q8NEV9 243 aa22.64■■□□□ 1.22
CLN8-211ENST00000636934 RILPL2Q969X0 211 aa22.64■■□□□ 1.22
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CLN8-211ENST00000636934 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 UTYO14607 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 CHMLP26374 656 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.63■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.62■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 PDIA6Q15084 440 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.61■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 CYP27B1O15528 508 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 GPATCH3Q96I76 525 aa22.6■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 CABP4P57796 275 aa22.59■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 MCM2P49736 904 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 CNTROBQ8N137 903 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-211ENST00000636934 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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CLN8-211ENST00000636934 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.58■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 SLAIN2Q9P270 581 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 STRCQ7RTU9 1775 aa22.56■■□□□ 1.2
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