RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-216ENST00000628306 USPL1Q5W0Q7 1092 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RNMTO43148 476 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A6Q13433 755 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR90Q96KV7 1748 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 NFIXQ14938 502 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 HMOX1P09601 288 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF181Q9P0P0 153 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNTO95613 3336 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-216ENST00000628306 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NARFQ9UHQ1 456 aa32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 UBR2Q8IWV8 1755 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 COL15A1P39059 1388 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZPR1O75312 459 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PRELPP51888 382 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ANP32CO43423 234 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 HTRA3P83110 453 aa32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF7Q02833 373 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-216ENST00000628306 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM2BQ8NHM5 1336 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 FSTL1Q12841 308 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 RRAGCQ9HB90 399 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB2P05120 415 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CCER2I3L3R5 266 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 JMYQ8N9B5 988 aa32.32■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRG1Q96E93 195 aa32.32■■■□□ 2.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKBIEO00221 500 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 LMNB1P20700 586 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL6Q8N841 843 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17REQ8NFR9 667 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN7AQ01118 1682 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TIAM2Q8IVF5 1701 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 GLTPD2A6NH11 291 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 HEG1Q9ULI3 1381 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC1BQ8NDV3 1235 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD3NLO95772 234 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF790Q6PG37 636 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 POTECB2RU33 542 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YIN7 160 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WZG4 1122 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS2L2Q8NHY3 880 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNQ3O43525 872 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMTA2O94983 1202 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 A1BGP04217 495 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TEFQ10587 303 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-216ENST00000628306 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 C21orf2O43822 256 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PHACTR3Q96KR7 559 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 BCORQ6W2J9 1755 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SLX4Q8IY92 1834 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE6BP35913 854 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 LTBP3Q9NS15 1303 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RALBP1Q15311 655 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-216ENST00000628306 USP16Q9Y5T5 823 aa32.06■■■□□ 2.72
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