RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619529.1

LINC00854-215, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-215	ENST00000619529	NFIX	Q14938	502 aa		13.97	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.97	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	ZPR1	O75312	459 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.96	□□□□□ -0.17
LINC00854-215	ENST00000619529	CAPN15	O75808	1086 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	HTRA3	P83110	453 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.95	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	MRC1	P22897	1456 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	SERPINB2	P05120	415 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	RASSF7	Q02833	373 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	SBF1	O95248	1867 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	COL15A1	P39059	1388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	SLC34A2	O95436	690 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	FSTL1	Q12841	308 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LINC00854-215	ENST00000619529	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	NFKBIE	O00221	500 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	LMNB1	P20700	586 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	POTEC	B2RU33	542 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	KCNQ3	O43525	872 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	STARD3NL	O95772	234 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529		H0YIN7	160 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	A1BG	P04217	495 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529		A0A087WZG4	1122 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	TEF	Q10587	303 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.83	□□□□□ -0.19
LINC00854-215	ENST00000619529	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	C21orf2	O43822	256 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.83	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.82	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.82	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.82	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	PDE6B	P35913	854 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.8	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	SRGN	P10124	158 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.79	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
LINC00854-215	ENST00000619529	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.78	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms