RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611394.4

PRR5-216, Transcript of proline rich 5, human

TSL 2 BASIC

Gene PRR5, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR5-216	ENST00000611394	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		41	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		41	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	ATG3	Q9NT62	314 aa		41	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	RGS12	O14924	1447 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	USP16	Q9Y5T5	823 aa		40.95	■■■■■ 4.15
PRR5-216	ENST00000611394	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	AAMP	Q13685	434 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	40.92	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	ANXA1	P04083	346 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	HYPK	Q9NX55	129 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	PROSER3	Q2NL68	480 aa		40.88	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.14
PRR5-216	ENST00000611394	PDIA6	Q15084	440 aa		40.86	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	KCNQ2	O43526	872 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394		F6X3S4	739 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	ERBB4	Q15303	1308 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
PRR5-216	ENST00000611394	NHS	Q6T4R5	1651 aa		40.82	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	MYL6B	P14649	208 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PRR5-216	ENST00000611394	PALLD	Q8WX93	1383 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	STARD3NL	O95772	234 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	TJP1	Q07157	1748 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	A1BG	P04217	495 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	ADCY9	O60503	1353 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	BTAF1	O14981	1849 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	NBPF26	B4DH59	902 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	NBPF14	Q5TI25	921 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	KSR2	Q6VAB6	950 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	NBPF15	Q8N660	670 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	RXRB	P28702	533 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	COPS6	Q7L5N1	327 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	SIK1	P57059	783 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRR5-216	ENST00000611394	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	ATP6V1A	P38606	617 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	ATP10D	Q9P241	1426 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRR5-216	ENST00000611394	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	BEND3	Q5T5X7	828 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	MEIS3	Q99687	375 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PRR5-216	ENST00000611394	ITPK1	Q13572	414 aa		40.56	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	POTEA	Q6S8J7	498 aa		40.56	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		40.56	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	ALDH1L1	O75891	902 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	IGHD	P01880	384 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	GNAI3	P08754	354 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	LINS1	Q8NG48	757 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
PRR5-216	ENST00000611394	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		40.52	■■■■■ 4.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms