RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574026.2

ITGAE-209, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-209ENST00000574026 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 RDH13Q8NBN7 331 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 RUNDC1Q96C34 613 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 NBPF3Q9H094 633 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 USP31Q70CQ4 1352 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.86□□□□□ -1.47
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ITGAE-209ENST00000574026 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 SSH2Q76I76 1423 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.86□□□□□ -1.47
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ITGAE-209ENST00000574026 SLC10A3P09131 477 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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ITGAE-209ENST00000574026 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 KIF1AQ12756 1690 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 HRO43593 1189 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 ATF3P18847 181 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 GCGRP47871 477 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 CCDC27Q2M243 656 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 NME9Q86XW9 330 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 POLKQ9UBT6 870 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 SHPRHQ149N8 1683 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 MSH6P52701 1360 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 SPTLC1O15269 473 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 BCAR3O75815 825 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 PSME1Q06323 249 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 SLF2Q8IX21 1173 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 USP54Q70EL1 1684 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGAE-209ENST00000574026 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 E9PSI1 815 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 KDM4AO75164 1064 aa5.83□□□□□ -1.48
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ITGAE-209ENST00000574026 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 WDR63Q8IWG1 891 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 BACH2Q9BYV9 841 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 C1orf167Q5SNV9 1468 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 SBNO1A3KN83 1393 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 RTL1A6NKG5 1358 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 TMEM94Q12767 1356 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 NDUFV2P19404 249 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 HSPA2P54652 639 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 USP46P62068 366 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 ABTB2Q8N961 1025 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 MST1RQ04912 1400 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 FLT4P35916 1363 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 STRCQ7RTU9 1775 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 HOXA2O43364 376 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 RNF40O75150 1001 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 IL13P35225 146 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 AMPHP49418 695 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 FLIIQ13045 1269 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 WWC1Q8IX03 1113 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 IL16Q14005 1332 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 PIK3C2AO00443 1686 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 CFHP08603 1231 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGAE-209ENST00000574026 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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