RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 BTBD11A6QL63 1104 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 PIM2Q9P1W9 311 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 DPEP1P16444 411 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 ATP10DQ9P241 1426 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 TM4SF1P30408 202 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 DDR1Q08345 913 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 ADCY9O60503 1353 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 NFIXQ14938 502 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 SERPINB2P05120 415 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-211ENST00000568829 KCNA3P22001 575 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 NPHP1O15259 732 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 RALBP1Q15311 655 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 MCM10Q7L590 875 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 H0YIN7 160 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 CHRNA5P30532 468 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 SETDB2Q96T68 719 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 A1BGP04217 495 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 PDE6BP35913 854 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 TTLL6Q8N841 843 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-211ENST00000568829 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 KCNQ3O43525 872 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 ST5P78524 1137 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 USP16Q9Y5T5 823 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 RGL2O15211 777 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 DCTN1Q14203 1278 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 NFE2L2Q16236 605 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 CNBD1Q8NA66 436 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 CAMTA2O94983 1202 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 RNF181Q9P0P0 153 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-211ENST00000568829 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 TOMM70O94826 608 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 SCN7AQ01118 1682 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 KIF3CO14782 793 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 LMNB1P20700 586 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 CNKSR1Q969H4 720 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 HSPA6P17066 643 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 SOGA3Q5TF21 947 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 RIPK4P57078 832 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 STYK1Q6J9G0 422 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 MASTLQ96GX5 879 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-211ENST00000568829 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
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