RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	COL15A1	P39059	1388 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DDR1	Q08345	913 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF790	Q6PG37	636 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FCHSD2	O94868	740 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-208	ENST00000564966	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	NARF	Q9UHQ1	456 aa		33.82	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	BTBD11	A6QL63	1104 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	TM4SF1	P30408	202 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-208	ENST00000564966	NEFM	P07197	916 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A087WZG4	1122 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	NFIX	Q14938	502 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM10	Q7L590	875 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCY9	O60503	1353 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	CHRNA5	P30532	468 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNQ3	O43525	872 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNA3	P22001	575 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-208	ENST00000564966	SERPINB2	P05120	415 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	A1BG	P04217	495 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PPP4C-208	ENST00000564966	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	NPHP1	O15259	732 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	USP16	Q9Y5T5	823 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-208	ENST00000564966	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	SCN7A	Q01118	1682 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966		H0YIN7	160 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	SETDB2	Q96T68	719 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF181	Q9P0P0	153 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	CAMTA2	O94983	1202 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL6	Q8N841	843 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-208	ENST00000564966	RALBP1	Q15311	655 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	NFE2L2	Q16236	605 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	33.51	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	CNBD1	Q8NA66	436 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE6B	P35913	854 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF3C	O14782	793 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	ST5	P78524	1137 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	RASSF7	Q02833	373 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF26	B4DH59	902 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NGEF	Q8N5V2	710 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF15	Q8N660	670 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM177B	A6PVY3	158 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA6	P17066	643 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP4C-208	ENST00000564966	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94

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