RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 TNP2Q05952 138 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 BCANQ96GW7 911 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 MDFIQ99750 246 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-202ENST00000558300 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 GATA4P43694 442 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 USP4Q13107 963 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 TLR1Q15399 786 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 SCNN1DP51172 638 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 PLVAPQ9BX97 442 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 FAM157BP0CG42 384 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 INHAP05111 366 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 PLA2G4AP47712 749 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PNR3 127 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 EFSO43281 561 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 CD33P20138 364 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 LAMC2Q13753 1193 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 ARTNQ5T4W7 220 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 LCE3BQ5TA77 95 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-202ENST00000558300 SIRT1Q96EB6 747 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 APBB1O00213 710 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 DYRK3O43781 588 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 SMTNP53814 917 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 MTFR1Q15390 333 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ELOA3Q8NG57 546 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ZIC5Q96T25 663 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 GDF10P55107 478 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 CDK2AP1O14519 115 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 STRN4Q9NRL3 753 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 MARK1Q9P0L2 795 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 SIN3BO75182 1162 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 AIDAQ96BJ3 306 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 SNRKQ9NRH2 765 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-202ENST00000558300 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 ALAS2P22557 587 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 TNFRSF25Q93038 417 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 A6NJY4 79 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 APBA3O96018 575 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 IRF5Q13568 498 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 SYT9Q86SS6 491 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 NACC1Q96RE7 527 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 USP3Q9Y6I4 520 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 NID1P14543 1247 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 M0R082 166 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 IL27Q8NEV9 243 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-202ENST00000558300 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms