RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 SLC39A6Q13433 755 aa22.81■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 HMOX1P09601 288 aa22.8■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 NFIXQ14938 502 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 NARFQ9UHQ1 456 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 HTRA3P83110 453 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 RASSF7Q02833 373 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 RRAGCQ9HB90 399 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PRRX1-208ENST00000553786 KLRG1Q96E93 195 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 SERPINB2P05120 415 aa22.75■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 LMNB1P20700 586 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 TTLL6Q8N841 843 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 SBF1O95248 1867 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-208ENST00000553786 STARD3NLO95772 234 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 JMYQ8N9B5 988 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 H0YIN7 160 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 GLTPD2A6NH11 291 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 PRELPP51888 382 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 A0A087WZG4 1122 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 NFKBIEO00221 500 aa22.66■■□□□ 1.22
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PRRX1-208ENST00000553786 TEFQ10587 303 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.64■■□□□ 1.22
PRRX1-208ENST00000553786 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 SCN7AQ01118 1682 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF790Q6PG37 636 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 PDE6BP35913 854 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 C21orf2O43822 256 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 IL17REQ8NFR9 667 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 NPHP1O15259 732 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 CNBD1Q8NA66 436 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRX1-208ENST00000553786 PCNTO95613 3336 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 ERFEQ4G0M1 354 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 SETDB2Q96T68 719 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 A1BGP04217 495 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 TNS4Q8IZW8 715 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 POTECB2RU33 542 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 CAMTA2O94983 1202 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 ST5P78524 1137 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 CAPN15O75808 1086 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 CNKSR1Q969H4 720 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 BTBD11A6QL63 1104 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 STYK1Q6J9G0 422 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-208ENST00000553786 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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