RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.22□□□□□ -0.29
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CS-217ENST00000550044 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-217ENST00000550044 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
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CS-217ENST00000550044 KIF3CO14782 793 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-217ENST00000550044 AMPHP49418 695 aa13.2□□□□□ -0.3
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CS-217ENST00000550044 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
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CS-217ENST00000550044 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
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CS-217ENST00000550044 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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CS-217ENST00000550044 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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CS-217ENST00000550044 POLKQ9UBT6 870 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 PCNTO95613 3336 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 HTRA3P83110 453 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-217ENST00000550044 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.1□□□□□ -0.31
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CS-217ENST00000550044 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.09□□□□□ -0.31
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CS-217ENST00000550044 FLT4P35916 1363 aa13.08□□□□□ -0.31
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CS-217ENST00000550044 UBR3Q6ZT12 1888 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 INSRP06213 1382 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 PHF14O94880 888 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 PALLDQ8WX93 1383 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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CS-217ENST00000550044 SMIM5Q71RC9 77 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 JMYQ8N9B5 988 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 AK7Q96M32 723 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.06□□□□□ -0.32
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CS-217ENST00000550044 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
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CS-217ENST00000550044 MTHFSP49914 203 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
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CS-217ENST00000550044 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.02□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 KIF13BQ9NQT8 1826 aa13.02□□□□□ -0.32
CS-217ENST00000550044 LHX6Q9UPM6 363 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 ITGB4P16144 1822 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.01□□□□□ -0.33
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