RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 TEFQ10587 303 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 NECTIN2Q92692 538 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 DCTPP1Q9H773 170 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 ZNF790Q6PG37 636 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 ANXA1P04083 346 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 SLC39A6Q13433 755 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 GCC1Q96CN9 775 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 DCAF5Q96JK2 942 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 USP44Q9H0E7 712 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-203ENST00000546585 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 BEND3Q5T5X7 828 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 STK31Q9BXU1 1019 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 LNPKQ9C0E8 428 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 BARGINQ6ZT62 677 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 USP35Q9P2H5 1018 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 TJP1Q07157 1748 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 VPS72Q15906 364 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NGLY1Q96IV0 654 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 C8orf37Q96NL8 207 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SBF2Q86WG5 1849 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 USP16Q9Y5T5 823 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 UTYO14607 1347 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 EXOC5O00471 708 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 ATP8B2P98198 1209 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 POLA2Q14181 598 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SSH3Q8TE77 659 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 KAZALD1Q96I82 304 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 USP21Q9UK80 565 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NBPF26B4DH59 902 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 GNAI2P04899 355 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 IGKV5-2P06315 115 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 GNAI3P08754 354 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 MTX1Q13505 466 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DDB1Q16531 1140 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NBPF14Q5TI25 921 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 KSR2Q6VAB6 950 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 NBPF15Q8N660 670 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-203ENST00000546585 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ATRNO75882 1429 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 CABP4P57796 275 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 HYPKQ9NX55 129 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.64□□□□□ -1.03
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