RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SRGAP3O43295 1099 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0232Q92628 1395 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ARID3AQ99856 593 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 CEP85Q6P2H3 762 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 SLAIN2Q9P270 581 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 USP19O94966 1318 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRB2O60241 1585 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 CDC45O75419 566 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 CLSTN1O94985 981 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 MCCP23508 829 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ERBB3P21860 1342 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 DCTPP1Q9H773 170 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 KDRP35968 1356 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 SSH2Q76I76 1423 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 RTL1A6NKG5 1358 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ4P48050 445 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 SIL1Q9H173 461 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PIP4K2BP78356 416 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS2O95450 1211 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 TERF1P54274 439 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 REC8O95072 547 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF790Q6PG37 636 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PHF14O94880 888 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PSEN1P49768 467 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 CRB1P82279 1406 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 BRINP3Q76B58 766 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF592Q92610 1267 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 COPS6Q7L5N1 327 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 HYPKQ9NX55 129 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH3Q96I76 525 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 MYD88Q99836 296 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 MX1P20591 662 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 SLC20A2Q08357 652 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 PROSER3Q2NL68 480 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 USP44Q9H0E7 712 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.5□□□□□ -0.89
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