RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RASSF7Q02833 373 aa27.62■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NFIXQ14938 502 aa27.62■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.62■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNS4Q8IZW8 715 aa27.62■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.61■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POTECB2RU33 542 aa27.6■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.6■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL13P35225 146 aa27.59■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.59■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MRC1P22897 1456 aa27.58■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.58■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PANK3Q9H999 370 aa27.58■■■□□ 2.01
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TTLL6Q8N841 843 aa27.57■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NFKBIEO00221 500 aa27.56■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SERPINB2P05120 415 aa27.56■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LGR6Q9HBX8 967 aa27.56■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.55■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL15A1P39059 1388 aa27.55■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.53■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.52■■■□□ 2
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.51■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CAPN15O75808 1086 aa27.51■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.5■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC39A6Q13433 755 aa27.5■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MORC1Q86VD1 984 aa27.5■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.5■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 H0YIN7 160 aa27.49■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.47■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.47■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.46■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.46■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.44■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.44■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.44■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.44■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CREBZFQ9NS37 354 aa27.43■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A087WZG4 1122 aa27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDE6BP35913 854 aa27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERFEQ4G0M1 354 aa27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.39■■□□□ 1.98
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C21orf2O43822 256 aa27.38■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.38■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHADLQ6NUI6 762 aa27.38■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.38■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STARD3NLO95772 234 aa27.37■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.36■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.35■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCN7AQ01118 1682 aa27.35■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PASKQ96RG2 1323 aa27.35■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HMOX1P09601 288 aa27.34■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POTEIP0CG38 1075 aa27.34■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POTEJP0CG39 1038 aa27.34■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STYK1Q6J9G0 422 aa27.32■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.32■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CNTNAP1P78357 1384 aa27.32■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.32■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRGNP10124 158 aa27.31■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLX4Q8IY92 1834 aa27.31■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF790Q6PG37 636 aa27.3■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.3■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CNKSR1Q969H4 720 aa27.3■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.3■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXN1O15353 648 aa27.29■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.29■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL17REQ8NFR9 667 aa27.29■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.29■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.28■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CAMTA2O94983 1202 aa27.28■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SOGA3Q5TF21 947 aa27.28■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.28■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCN4AP35499 1836 aa27.27■■□□□ 1.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LDHDQ86WU2 507 aa27.26■■□□□ 1.95
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.25■■□□□ 1.95
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms