RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512247.5

LNX1-208, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 3

Gene LNX1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-208ENST00000512247 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.65□□□□□ -0.54
LNX1-208ENST00000512247 CFAP44Q96MT7 982 aa11.65□□□□□ -0.54
LNX1-208ENST00000512247 H0YIN7 160 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 POTEIP0CG38 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 POTEJP0CG39 1038 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 TM4SF1P30408 202 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.63□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 NFKBIEO00221 500 aa11.63□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 TESK2Q96S53 571 aa11.63□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.62□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 WBP1LQ9NX94 342 aa11.62□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.62□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 C21orf2O43822 256 aa11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 SERPINB2P05120 415 aa11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 MTHFSP49914 203 aa11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 NFIXQ14938 502 aa11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 LDHDQ86WU2 507 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.6□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 NCAPD2Q15021 1401 aa11.59□□□□□ -0.55
LNX1-208ENST00000512247 NPHP1O15259 732 aa11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 GRM1Q13255 1194 aa11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 PASKQ96RG2 1323 aa11.58□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 SBF1O95248 1867 aa11.57□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.57□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 NARFQ9UHQ1 456 aa11.57□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.56□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.56□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 PDE6BP35913 854 aa11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 POLKQ9UBT6 870 aa11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.55□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 RGS19P49795 217 aa11.54□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 COL15A1P39059 1388 aa11.54□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.54□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 RASSF10A6NK89 507 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 CNTROBQ8N137 903 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 HACL1Q9UJ83 578 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 TSKSQ9UJT2 592 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.53□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.52□□□□□ -0.56
LNX1-208ENST00000512247 ANP32CO43423 234 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 EPHX2P34913 555 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 SOGA3Q5TF21 947 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 CNKSR1Q969H4 720 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.52□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 ECE1P42892 770 aa11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 SLC39A6Q13433 755 aa11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 CAPNS2Q96L46 248 aa11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.51□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.5□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.5□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.5□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.49□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 A0A087WZG4 1122 aa11.49□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 ST5P78524 1137 aa11.49□□□□□ -0.57
LNX1-208ENST00000512247 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms