RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496553.5

NDUFS2-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 888 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-215	ENST00000496553	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.17	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.17	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.16	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.16	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	ADCY9	O60503	1353 aa		28.15	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.15	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	FCHSD2	O94868	740 aa		28.15	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	DDR1	Q08345	913 aa		28.14	■■■□□ 2.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553		A0A087WZG4	1122 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	TM4SF1	P30408	202 aa		28.12	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.11	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.11	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.1	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	NEFM	P07197	916 aa		28.1	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
NDUFS2-215	ENST00000496553	NFIX	Q14938	502 aa		28.07	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.06	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	KCNA3	P22001	575 aa		28.05	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	SERPINB2	P05120	415 aa		28.03	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	CHRNA5	P30532	468 aa		28.02	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.02	■■■□□ 2.08
NDUFS2-215	ENST00000496553	MCM10	Q7L590	875 aa		28.01	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.01	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.99	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	KCNQ3	O43525	872 aa		27.97	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	A1BG	P04217	495 aa		27.97	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.97	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
NDUFS2-215	ENST00000496553		H0YIN7	160 aa		27.95	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.95	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.95	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	NPHP1	O15259	732 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.93	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.93	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	PDE6B	P35913	854 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.9	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIF3C	O14782	793 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	RALBP1	Q15311	655 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	ST5	P78524	1137 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSPA6	P17066	643 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.85	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	TOMM70	O94826	608 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	SBF1	O95248	1867 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	RGL2	O15211	777 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	LMNB1	P20700	586 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	RASSF7	Q02833	373 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04

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