RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CLIP2-208	ENST00000491075	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.14	■■■□□ 2.1
CLIP2-208	ENST00000491075	COL15A1	P39059	1388 aa		28.12	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	KLRG1	Q96E93	195 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	NFIX	Q14938	502 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	HTRA3	P83110	453 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	RASSF7	Q02833	373 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	JMY	Q8N9B5	988 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	HMOX1	P09601	288 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	LMNB1	P20700	586 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	SERPINB2	P05120	415 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CLIP2-208	ENST00000491075	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	PCNT	O95613	3336 aa		28	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075		H0YIN7	160 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	STARD3NL	O95772	234 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CLIP2-208	ENST00000491075		A0A087WZG4	1122 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	PRELP	P51888	382 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	NFKBIE	O00221	500 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	TEF	Q10587	303 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CLIP2-208	ENST00000491075	PDE6B	P35913	854 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	CACNA1S	Q13698	1873 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	C21orf2	O43822	256 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CLIP2-208	ENST00000491075	POTEC	B2RU33	542 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	SLX4	Q8IY92	1834 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	NPHP1	O15259	732 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	ST5	P78524	1137 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	A1BG	P04217	495 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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