RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488488.1

TMOD4-205, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD4, Length 613 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-205ENST00000488488 USP44Q9H0E7 712 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD4-205ENST00000488488 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD4-205ENST00000488488 STRN4Q9NRL3 753 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD4-205ENST00000488488 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD4-205ENST00000488488 DISP2A7MBM2 1401 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD4-205ENST00000488488 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SEC24BO95487 1268 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 ANXA1P04083 346 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PDIA6Q15084 440 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PROSER3Q2NL68 480 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 ERBB4Q15303 1308 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 C5P01031 1676 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TNS2Q63HR2 1409 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PAPPAQ13219 1627 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 BTG4Q9NY30 223 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 POLA2Q14181 598 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SSH3Q8TE77 659 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LRP6O75581 1613 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 MTX1Q13505 466 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TTC22Q5TAA0 569 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LINS1Q8NG48 757 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 UTYO14607 1347 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 RAB11FIP3O75154 756 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 CDC45O75419 566 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 PHLPP1O60346 1717 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 AOX1Q06278 1338 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 GRM8O00222 908 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TOM1O60784 492 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 USP16Q9Y5T5 823 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 COL15A1P39059 1388 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 APBB1O00213 710 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 SRGAP3O43295 1099 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 IGKV5-2P06315 115 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 MYL6BP14649 208 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 BECN1Q14457 450 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 COPS6Q7L5N1 327 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD4-205ENST00000488488 NRAPQ86VF7 1730 aa8.4□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 MX1P20591 662 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 PDE1AP54750 535 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 GCKRQ14397 625 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 SUCLG2Q96I99 432 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 MYD88Q99836 296 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 USP35Q9P2H5 1018 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 STAP2Q9UGK3 403 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF26B4DH59 902 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 SDSP20132 328 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF14Q5TI25 921 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms