RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDRF1-208	ENST00000481600	MX1	P20591	662 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	CRB1	P82279	1406 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	TPM3	P06753	285 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	EYA1	Q99502	592 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	MPND	Q8N594	471 aa		13.97	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	MBD3	O95983	291 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	EVA1C	P58658	441 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	FIBP	O43427	364 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	TRDN	Q13061	729 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	C3	P01024	1663 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.96	□□□□□ -0.17
EDRF1-208	ENST00000481600	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.96	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.96	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.96	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.95	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	LTK	P29376	864 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF445	P59923	1031 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PKP1	Q13835	747 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TRIM29	Q14134	588 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.94	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.93	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	MARCH6	O60337	910 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ANAPC15	P60006	121 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	CHML	P26374	656 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	PSMA5	P28066	241 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EDRF1-208	ENST00000481600	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.9	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	KDR	P35968	1356 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	TPM1	P09493	284 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	PDC	P20941	246 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	PDE4C	Q08493	712 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	HOXC9	P31274	260 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	SYCE3	A1L190	88 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EDRF1-208	ENST00000481600	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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