RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 PIM2Q9P1W9 311 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 TOMM70O94826 608 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 RASSF7Q02833 373 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 IL17REQ8NFR9 667 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 NARFQ9UHQ1 456 aa14.79□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 COL15A1P39059 1388 aa14.78□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NISCH-206ENST00000474188 KCNQ3O43525 872 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 RNF181Q9P0P0 153 aa14.77□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 SBF1O95248 1867 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 SERPINB2P05120 415 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 RRAGCQ9HB90 399 aa14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 ZPR1O75312 459 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 APLP1P51693 650 aa14.75□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 PCNTO95613 3336 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 NFKBIEO00221 500 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 POTECB2RU33 542 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 A1BGP04217 495 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-206ENST00000474188 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.71□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 WDR90Q96KV7 1748 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF790Q6PG37 636 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 TTLL6Q8N841 843 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 CAMTA2O94983 1202 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 JMYQ8N9B5 988 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 KLRG1Q96E93 195 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 USP16Q9Y5T5 823 aa14.68□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 GLTPD2A6NH11 291 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 LMNB1P20700 586 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 FSTL1Q12841 308 aa14.67□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 SCN7AQ01118 1682 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 STARD3NLO95772 234 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 C21orf2O43822 256 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 PRKAR2BP31323 418 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-206ENST00000474188 NBPF26B4DH59 902 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 H0YIN7 160 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 POTEIP0CG38 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 POTEJP0CG39 1038 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 DCTN1Q14203 1278 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 NBPF15Q8N660 670 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 TEFQ10587 303 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 MCM10Q7L590 875 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 SLX4Q8IY92 1834 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 A0A087WZG4 1122 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 BTBD11A6QL63 1104 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 OLFM4Q6UX06 510 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 SLC51AQ86UW1 340 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 SRGNP10124 158 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-206ENST00000474188 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms