RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	SCP2	P22307	547 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NBPF11	Q86T75	865 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	AK7	Q96M32	723 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	IVL	P07476	585 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF75D	P51815	510 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	UBE2H	P62256	183 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	LUZP1	Q86V48	1076 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ELP1	O95163	1332 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF3C	O14782	793 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	C21orf2	O43822	256 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	KAT2B	Q92831	832 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	GCC1	Q96CN9	775 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147		H3BQF6	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SHPRH	Q149N8	1683 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NOS1	P29475	1434 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC36	A6NLP5	189 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC192	P0DO97	292 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCZ1B	P86790	482 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC27	Q2M243	656 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	MIEF2	Q96C03	454 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	RUNDC1	Q96C34	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIM5	Q9C035	493 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CLSTN1	O94985	981 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SMC2	O95347	1197 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SKIL	P12757	684 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NEK4	P51957	841 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	ITFG2	Q969R8	447 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CBX8	Q9HC52	389 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	FBXO3	Q9UK99	471 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	DISP1	Q96F81	1524 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	MNAT1	P51948	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	FUT8	Q9BYC5	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	MYOM1	P52179	1685 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	NES	P48681	1621 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RBMS1-208	ENST00000474147	RTL1	A6NKG5	1358 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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