RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	KDR	P35968	1356 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	BAG6	P46379	1132 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	EYA1	Q99502	592 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	MTHFS	P49914	203 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	BTAF1	O14981	1849 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	PLSCR1	O15162	318 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D12	O60347	775 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	TRIM37	O94972	964 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	IL13	P35225	146 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	LY75	O60449	1722 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP34-208	ENST00000467128	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	RALBP1	Q15311	655 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	ITGB4	P16144	1822 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	PPP2R1A	P30153	589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.25	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	CYP27B1	O15528	508 aa		11.25	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	APBA3	O96018	575 aa		11.25	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.25	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.24	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.24	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.24	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	PHKG2	P15735	406 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	FOSB	P53539	338 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	MRC1	P22897	1456 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	KCNQ2	O43526	872 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP34-208	ENST00000467128	LRP5	O75197	1615 aa		11.2	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.2	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.2	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.2	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	C5	P01031	1676 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.19	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	FCHSD2	O94868	740 aa		11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	EVI5	O60447	810 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	HMOX1	P09601	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.17	□□□□□ -0.62
USP34-208	ENST00000467128	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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