RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LBX1P52954 281 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CABP4P57796 275 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TTLL6Q8N841 843 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABHD8Q96I13 439 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CACNA1SQ13698 1873 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.46■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZPR1O75312 459 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 VEGFBP49765 207 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NFIXQ14938 502 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERFEQ4G0M1 354 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WBP1LQ9NX94 342 aa16.43■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PASKQ96RG2 1323 aa16.43■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SERPINB2P05120 415 aa16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 H0YIN7 160 aa16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLC24A1O60721 1099 aa16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 POLKQ9UBT6 870 aa16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 C21orf2O43822 256 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCN4AP35499 1836 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MTHFSP49914 203 aa16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.38■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NARFQ9UHQ1 456 aa16.38■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 COL15A1P39059 1388 aa16.38■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LDHDQ86WU2 507 aa16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLX4Q8IY92 1834 aa16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.33■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.33■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RGS19P49795 217 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RASSF10A6NK89 507 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFAP44Q96MT7 982 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PDE6BP35913 854 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLC39A6Q13433 755 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CDCA8Q53HL2 280 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCN7AQ01118 1682 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EPHX2P34913 555 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GRM1Q13255 1194 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CNTROBQ8N137 903 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HACL1Q9UJ83 578 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TSKSQ9UJT2 592 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LGR6Q9HBX8 967 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LTBP1Q14766 1721 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms