RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.35■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.35■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNNQ9UQP3 1299 aa19.35■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RLBP1P12271 317 aa19.34■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RXRBP28702 533 aa19.34■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP16Q9Y5T5 823 aa19.34■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FLIIQ13045 1269 aa19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 G2E3Q7L622 706 aa19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HYPKQ9NX55 129 aa19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COG6Q9Y2V7 657 aa19.33■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC4O15439 1325 aa19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERBB4Q15303 1308 aa19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNQ2O43526 872 aa19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BTAF1O14981 1849 aa19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM182BQ5T319 152 aa19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGS12O14924 1447 aa19.3■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TJP1Q07157 1748 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AAMPQ13685 434 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDIA6Q15084 440 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM196AQ6ZSG2 479 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.29■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANXA1P04083 346 aa19.28■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PROSER3Q2NL68 480 aa19.28■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PALLDQ8WX93 1383 aa19.28■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STARD3NLO95772 234 aa19.27■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.27■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYL6BP14649 208 aa19.26■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.26■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.26■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.25■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SIK1P57059 783 aa19.25■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POTEAQ6S8J7 498 aa19.25■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.24■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LY75O60449 1722 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF26B4DH59 902 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 F6X3S4 739 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A1BGP04217 495 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP6V1AP38606 617 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF14Q5TI25 921 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KSR2Q6VAB6 950 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NBPF15Q8N660 670 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.23■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COPS6Q7L5N1 327 aa19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADCY9O60503 1353 aa19.21■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RREB1Q92766 1687 aa19.2■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.2■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP10DQ9P241 1426 aa19.18■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITPK1Q13572 414 aa19.18■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.18■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM37O94972 964 aa19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BEND3Q5T5X7 828 aa19.16■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.16■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALDH1L1O75891 902 aa19.15■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.15■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms