RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 TNNQ9UQP3 1299 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 A2MP01023 1474 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TTC22Q5TAA0 569 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ADGRL2O95490 1459 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 KDM5CP41229 1560 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 MAP3K11Q16584 847 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CHRNA2Q15822 529 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 KIF20AO95235 890 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 RBSNQ9H1K0 784 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZNF521Q96K83 1311 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 JMYQ8N9B5 988 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ME1P48163 572 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 PDILTQ8N807 584 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 FAM83GA6ND36 823 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 EXOC5O00471 708 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 MX1P20591 662 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TXLNAP40222 546 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CCDC69A6NI79 296 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 A0A087WZG4 1122 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 FLIIQ13045 1269 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 UBE2HP62256 183 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 KRT32Q14532 448 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 AIDAQ96BJ3 306 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ZPR1O75312 459 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TNNT1P13805 278 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 EPS15P42566 896 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TMX3Q96JJ7 454 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 FEZ1Q99689 392 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 KDM6BO15054 1643 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 NEMFO60524 1076 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 USP19O94966 1318 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-209ENST00000446688 ANXA1P04083 346 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 GPTP24298 496 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PTPN14Q15678 1187 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 AK7Q96M32 723 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 NEO1Q92859 1461 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.71□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TNRQ92752 1358 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 HYPKQ9NX55 129 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 RAB11FIP3O75154 756 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SOGA3Q5TF21 947 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 KIF18AQ8NI77 898 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 DDX11Q96FC9 970 aa11.7□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANAPC15P60006 121 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SMC2O95347 1197 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SPATA32Q96LK8 384 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.2 ms