RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 TJP1Q07157 1748 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 SERPINB2P05120 415 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 RASSF7Q02833 373 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 HMOX1P09601 288 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 LMNB1P20700 586 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 TTLL6Q8N841 843 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 COL15A1P39059 1388 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 PRELPP51888 382 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTBP11-201ENST00000436287 GLTPD2A6NH11 291 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 MRC1P22897 1456 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR90Q96KV7 1748 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 H0YIN7 160 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 STARD3NLO95772 234 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 NFKBIEO00221 500 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A087WZG4 1122 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTBP11-201ENST00000436287 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 SBF1O95248 1867 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 POTECB2RU33 542 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 PDE6BP35913 854 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF790Q6PG37 636 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 IL17REQ8NFR9 667 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TEFQ10587 303 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTBP11-201ENST00000436287 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 C21orf2O43822 256 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 ERFEQ4G0M1 354 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 TNS4Q8IZW8 715 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 PCNTO95613 3336 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 A1BGP04217 495 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 SETDB2Q96T68 719 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CAMTA2O94983 1202 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CNKSR1Q969H4 720 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 STYK1Q6J9G0 422 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CNBD1Q8NA66 436 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CAPN15O75808 1086 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 SRGNP10124 158 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTBP11-201ENST00000436287 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNQ3O43525 872 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 CHADLQ6NUI6 762 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 BTBD11A6QL63 1104 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 NPHP1O15259 732 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 ST5P78524 1137 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 SOGA3Q5TF21 947 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 MASTLQ96GX5 879 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 CREBZFQ9NS37 354 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTBP11-201ENST00000436287 USP16Q9Y5T5 823 aa20.06■□□□□ 0.8
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