RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		23.83	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	23.82	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP53	Q96M91	514 aa		23.82	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	23.81	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TM4SF1	P30408	202 aa		23.81	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A6	Q13433	755 aa		23.81	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	23.81	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		23.81	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		23.8	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRNA5	P30532	468 aa		23.79	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		23.79	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	FSTL1	Q12841	308 aa		23.78	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		23.78	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		23.78	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF181	Q9P0P0	153 aa		23.78	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		23.77	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	23.77	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	ZPR1	O75312	459 aa		23.77	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		23.77	■■□□□ 1.4
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKAR2B	P31323	418 aa		23.76	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	RRAGC	Q9HB90	399 aa		23.76	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDC	Q9Y266	331 aa		23.76	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	23.75	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		23.75	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		23.75	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		23.74	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	KLRG1	Q96E93	195 aa		23.74	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	SBF1	O95248	1867 aa		23.74	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	23.73	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR90	Q96KV7	1748 aa		23.73	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	HTRA3	P83110	453 aa		23.72	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	23.71	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	23.71	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	TEF	Q10587	303 aa		23.71	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	NARF	Q9UHQ1	456 aa		23.71	■■□□□ 1.39
MRPL28-203	ENST00000429738	NFIX	Q14938	502 aa		23.7	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF790	Q6PG37	636 aa		23.7	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	JMY	Q8N9B5	988 aa		23.7	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		23.69	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		23.69	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	23.68	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		23.67	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		23.67	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	COL15A1	P39059	1388 aa		23.66	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB2	P05120	415 aa		23.66	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	LMNB1	P20700	586 aa		23.66	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		23.66	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	23.66	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	23.65	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	RASSF7	Q02833	373 aa		23.65	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL6	Q8N841	843 aa		23.65	■■□□□ 1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	GLTPD2	A6NH11	291 aa		23.63	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	STARD3NL	O95772	234 aa		23.63	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	23.63	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	23.63	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PRELP	P51888	382 aa		23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		23.62	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD11	A6QL63	1104 aa		23.61	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YIN7	160 aa		23.61	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNQ3	O43525	872 aa		23.61	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	23.61	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	23.61	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	23.6	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	MCM10	Q7L590	875 aa		23.6	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PCNT	O95613	3336 aa		23.59	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		23.59	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WZG4	1122 aa		23.58	■■□□□ 1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		23.58	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		23.57	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN7A	Q01118	1682 aa		23.57	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN1	Q14203	1278 aa		23.57	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	NFKBIE	O00221	500 aa		23.56	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	23.56	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	RALBP1	Q15311	655 aa		23.56	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		23.56	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		23.55	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		23.54	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		23.54	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		23.53	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	23.53	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		23.53	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	USP16	Q9Y5T5	823 aa		23.53	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	POTEC	B2RU33	542 aa		23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	A1BG	P04217	495 aa		23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	NEFM	P07197	916 aa		23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE6B	P35913	854 aa		23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		23.52	■■□□□ 1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		23.51	■■□□□ 1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		23.51	■■□□□ 1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	23.51	■■□□□ 1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	TNS4	Q8IZW8	715 aa		23.51	■■□□□ 1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	NFE2L2	Q16236	605 aa		23.5	■■□□□ 1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms