RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 HMOX1P09601 288 aa14.8□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 SERPINB2P05120 415 aa14.79□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 KLRG1Q96E93 195 aa14.79□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.79□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 COL15A1P39059 1388 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 STARD3NLO95772 234 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 TTLL6Q8N841 843 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.78□□□□□ -0.04
SMIM25-201ENST00000421019 A0A087WZG4 1122 aa14.77□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 H0YIN7 160 aa14.77□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 LMNB1P20700 586 aa14.77□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 JMYQ8N9B5 988 aa14.77□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.77□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TJP1Q07157 1748 aa14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 MRC1P22897 1456 aa14.76□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 GLTPD2A6NH11 291 aa14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 HTRA3P83110 453 aa14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 RASSF7Q02833 373 aa14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.75□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.74□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.73□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TEFQ10587 303 aa14.73□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.73□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PDE6BP35913 854 aa14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.71□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PRELPP51888 382 aa14.71□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF790Q6PG37 636 aa14.71□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 IL17REQ8NFR9 667 aa14.71□□□□□ -0.05
SMIM25-201ENST00000421019 SBF1O95248 1867 aa14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 NFKBIEO00221 500 aa14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.7□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 WDR90Q96KV7 1748 aa14.69□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.69□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.69□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.69□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ERFEQ4G0M1 354 aa14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 SETDB2Q96T68 719 aa14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 NPHP1O15259 732 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 C21orf2O43822 256 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 CNKSR1Q969H4 720 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.67□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 A1BGP04217 495 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 CNBD1Q8NA66 436 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.66□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 POTECB2RU33 542 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 CAMTA2O94983 1202 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ST5P78524 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 SOGA3Q5TF21 947 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 STYK1Q6J9G0 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.65□□□□□ -0.06
SMIM25-201ENST00000421019 BTBD11A6QL63 1104 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 TNS4Q8IZW8 715 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 MASTLQ96GX5 879 aa14.64□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 SRGNP10124 158 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CFAP53Q96M91 514 aa14.63□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 KCNQ3O43525 872 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 PRKAR2BP31323 418 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CHADLQ6NUI6 762 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 NUDCQ9Y266 331 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.62□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms