RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF445P59923 1031 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 USP54Q70EL1 1684 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAI3P08754 354 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TMX3Q96JJ7 454 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GPT2Q8TD30 523 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PALD1Q9ULE6 856 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP8B2P98198 1209 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K5Q99683 1374 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNQ3O43525 872 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PXDNQ92626 1479 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMLP26374 656 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SLAIN2Q9P270 581 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF1AQ12756 1690 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MCCP23508 829 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RBSNQ9H1K0 784 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SLIT3O75094 1523 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ALS2Q96Q42 1657 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ERBB3P21860 1342 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 USP44Q9H0E7 712 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM2P49736 904 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA1P04083 346 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 STAP2Q9UGK3 403 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCE3A1L190 88 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CUL4AQ13619 759 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 IL25Q9H293 177 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC37A3O60309 1634 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DCCP43146 1447 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC15P60006 121 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD1O95696 1058 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 TEFQ10587 303 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SSH3Q8TE77 659 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 STRN4Q9NRL3 753 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA1FO60840 1977 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD3O95983 291 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A6Q13433 755 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 AOX1Q06278 1338 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD11A6QL63 1104 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SRGAP3O43295 1099 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF214Q8ND24 703 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 MEGF6O75095 1541 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA4P34932 840 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB11FIP3O75154 756 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.58■■□□□ 1.2
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