RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF213O14771 459 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ASXL2Q76L83 1435 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM83GA6ND36 823 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRKQ15262 1439 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 IQCA1Q86XH1 822 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF76P36508 570 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 C8orf76Q96K31 380 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4-203ENST00000409212 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 NGLY1Q96IV0 654 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 IL27Q8NEV9 243 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SLF2Q8IX21 1173 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 GPTP24298 496 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SYCE3A1L190 88 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 SKAP1Q86WV1 359 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ERLIN2O94905 339 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC22Q5TAA0 569 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ANO10Q9NW15 660 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC181Q5TID7 509 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 MPNDQ8N594 471 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLIM4O00461 696 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 LDHCP07864 332 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CHRNA2Q15822 529 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 MSH6P52701 1360 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP100Q494V2 611 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 ESPNB1AK53 854 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CTAGE5O15320 804 aa18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 IGHDP01880 384 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 FBLN1P23142 703 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ALDH1L1O75891 902 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CAMK4Q16566 473 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB34Q9BZG1 259 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 NUCB1Q02818 461 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ERLIN1O75477 346 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TNIP1Q15025 636 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 MAPKBP1O60336 1514 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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