RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FLIIQ13045 1269 aa25.65■■□□□ 1.7
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ODC1-202ENST00000405333 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 FAM182BQ5T319 152 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 ATG3Q9NT62 314 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 EP400Q96L91 3159 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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ODC1-202ENST00000405333 KCNQ2O43526 872 aa25.6■■□□□ 1.69
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ODC1-202ENST00000405333 FBXO41Q8TF61 875 aa25.58■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.58■■□□□ 1.69
ODC1-202ENST00000405333 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ODC1-202ENST00000405333 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.57■■□□□ 1.68
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ODC1-202ENST00000405333 ADCY9O60503 1353 aa25.51■■□□□ 1.67
ODC1-202ENST00000405333 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.51■■□□□ 1.67
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ODC1-202ENST00000405333 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.48■■□□□ 1.67
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ODC1-202ENST00000405333 COPS6Q7L5N1 327 aa25.47■■□□□ 1.67
ODC1-202ENST00000405333 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.47■■□□□ 1.67
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ODC1-202ENST00000405333 BTAF1O14981 1849 aa25.45■■□□□ 1.66
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ODC1-202ENST00000405333 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.44■■□□□ 1.66
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ODC1-202ENST00000405333 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.41■■□□□ 1.66
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ODC1-202ENST00000405333 SIK1P57059 783 aa25.41■■□□□ 1.66
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ODC1-202ENST00000405333 KCNQ4P56696 695 aa25.4■■□□□ 1.66
ODC1-202ENST00000405333 ITPK1Q13572 414 aa25.4■■□□□ 1.66
ODC1-202ENST00000405333 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.4■■□□□ 1.66
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
ODC1-202ENST00000405333 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.39■■□□□ 1.65
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ODC1-202ENST00000405333 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.37■■□□□ 1.65
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ODC1-202ENST00000405333 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.35■■□□□ 1.65
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ODC1-202ENST00000405333 RXRBP28702 533 aa25.33■■□□□ 1.65
ODC1-202ENST00000405333 MYD88Q99836 296 aa25.33■■□□□ 1.65
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.33■■□□□ 1.65
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