RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.44■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 PDIA6Q15084 440 aa31.44■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 FMNL2Q96PY5 1086 aa31.42■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 ERVV-2B6SEH9 535 aa31.41■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 PLCH1Q4KWH8 1693 aa31.41■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.41■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 ATP8B2P98198 1209 aa31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 KSR2Q6VAB6 950 aa31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 DDRGK1Q96HY6 314 aa31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 BMP2KLQ5H9B9 411 aa31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa31.39■■■□□ 2.62
REXO4-201ENST00000371935 WNK3Q9BYP7 1800 aa31.37■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 DISP2A7MBM2 1401 aa31.37■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 USP35Q9P2H5 1018 aa31.36■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 KCPQ6ZWJ8 1503 aa31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 DDX58O95786 925 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 USP16Q9Y5T5 823 aa31.35■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 ALDH1L1O75891 902 aa31.34■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
REXO4-201ENST00000371935 NRAPQ86VF7 1730 aa31.32■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.31■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 APBB1O00213 710 aa31.31■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 TNS2Q63HR2 1409 aa31.3■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 MYL6BP14649 208 aa31.3■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 SSH3Q8TE77 659 aa31.29■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa31.29■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.29■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 LINS1Q8NG48 757 aa31.28■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 TBC1D32Q96NH3 1257 aa31.28■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 POLA2Q14181 598 aa31.27■■■□□ 2.6
REXO4-201ENST00000371935 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 COPS6Q7L5N1 327 aa31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 ITGB4P16144 1822 aa31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.26■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 TOM1O60784 492 aa31.25■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 TTC22Q5TAA0 569 aa31.25■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 RIC3Q7Z5B4 369 aa31.25■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 CERKQ8TCT0 537 aa31.25■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 ERBB4Q15303 1308 aa31.24■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 LRP6O75581 1613 aa31.24■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 LRRCC1Q9C099 1032 aa31.23■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 BCL11AQ9H165 835 aa31.23■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 UTYO14607 1347 aa31.23■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 ANP32EQ9BTT0 268 aa31.22■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 IGKV5-2P06315 115 aa31.21■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 PIP4K2BP78356 416 aa31.21■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 TMOD3Q9NYL9 352 aa31.21■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 ADAMTS2O95450 1211 aa31.21■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
REXO4-201ENST00000371935 SRGAP3O43295 1099 aa31.2■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 MTX1Q13505 466 aa31.2■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa31.2■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NWD2Q9ULI1 1742 aa31.19■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 GRM8O00222 908 aa31.19■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 OSBPL3Q9H4L5 887 aa31.19■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.19■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 SALL3Q9BXA9 1300 aa31.19■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NEXNQ0ZGT2 675 aa31.18■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.18■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa31.18■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NUP188Q5SRE5 1749 aa31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NBPF26B4DH59 902 aa31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 CDC45O75419 566 aa31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NBPF14Q5TI25 921 aa31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NBPF15Q8N660 670 aa31.17■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 NEURL1BA8MQ27 555 aa31.16■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 MYD88Q99836 296 aa31.16■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 C22orf23Q9BZE7 217 aa31.16■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 RAB11FIP3O75154 756 aa31.16■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 PDE1AP54750 535 aa31.15■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 SURF6O75683 361 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 PIGBQ92521 554 aa31.14■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa31.14■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 EXOC5O00471 708 aa31.14■■■□□ 2.58
REXO4-201ENST00000371935 GCKRQ14397 625 aa31.13■■■□□ 2.57
REXO4-201ENST00000371935 SUCLG2Q96I99 432 aa31.13■■■□□ 2.57
REXO4-201ENST00000371935 PLBD2Q8NHP8 589 aa31.12■■■□□ 2.57
REXO4-201ENST00000371935 KAZALD1Q96I82 304 aa31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms