RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 FCHSD2O94868 740 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 KCNA3P22001 575 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 PPP2R1AP30153 589 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 NARFQ9UHQ1 456 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 NUDCQ9Y266 331 aa30.45■■■□□ 2.47
CLTB-202ENST00000345807 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 STARD3NLO95772 234 aa30.43■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 ZNF790Q6PG37 636 aa30.43■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.42■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 PIM2Q9P1W9 311 aa30.41■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.41■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.41■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 NFIXQ14938 502 aa30.39■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.39■■■□□ 2.46
CLTB-202ENST00000345807 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 CHRNA5P30532 468 aa30.37■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.37■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.36■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 A0A087WZG4 1122 aa30.35■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 BTBD11A6QL63 1104 aa30.35■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.33■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 SERPINB2P05120 415 aa30.33■■■□□ 2.45
CLTB-202ENST00000345807 KCNQ3O43525 872 aa30.32■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 BICDL1Q6ZP65 573 aa30.29■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 MCM10Q7L590 875 aa30.29■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 A1BGP04217 495 aa30.28■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 KIF3CO14782 793 aa30.27■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.27■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.27■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 SCN7AQ01118 1682 aa30.27■■■□□ 2.44
CLTB-202ENST00000345807 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.25■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 DCTN1Q14203 1278 aa30.24■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.24■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 USP16Q9Y5T5 823 aa30.23■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 C2CD5Q86YS7 1000 aa30.22■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.22■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.2■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 H0YIN7 160 aa30.2■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 RNF181Q9P0P0 153 aa30.2■■■□□ 2.43
CLTB-202ENST00000345807 CAMTA2O94983 1202 aa30.19■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 HSPA6P17066 643 aa30.19■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 NEFMP07197 916 aa30.18■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 TTLL6Q8N841 843 aa30.18■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.18■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 PRR5LQ6MZQ0 368 aa30.16■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 SETDB2Q96T68 719 aa30.16■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 SBF1O95248 1867 aa30.16■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 BCORQ6W2J9 1755 aa30.15■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.15■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 RASSF7Q02833 373 aa30.15■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.15■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 TOMM70O94826 608 aa30.14■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 PDE6BP35913 854 aa30.14■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.14■■■□□ 2.42
CLTB-202ENST00000345807 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.13■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 CEP350Q5VT06 3117 aa30.13■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.12■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.12■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.12■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 CNBD1Q8NA66 436 aa30.11■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.11■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 NPHP1O15259 732 aa30.1■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 NBPF26B4DH59 902 aa30.09■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 NBPF15Q8N660 670 aa30.09■■■□□ 2.41
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CLTB-202ENST00000345807 ST5P78524 1137 aa30.08■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 NFE2L2Q16236 605 aa30.08■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.08■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CLTB-202ENST00000345807 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.08■■■□□ 2.41
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CLTB-202ENST00000345807 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CLTB-202ENST00000345807 PRELPP51888 382 aa30.06■■■□□ 2.4
CLTB-202ENST00000345807 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.05■■■□□ 2.4
CLTB-202ENST00000345807 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CLTB-202ENST00000345807 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.05■■■□□ 2.4
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