RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHG5O94827 1062 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 IP6K1Q92551 441 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 RAD50Q92878 1312 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 IL25Q9H293 177 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 BEND3Q5T5X7 828 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 SGSM2O43147 1006 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD1-201ENST00000331462 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NCAPD2Q15021 1401 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 SRGAP3O43295 1099 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 MTX1Q13505 466 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.31■■□□□ 1.96
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HOXD1-201ENST00000331462 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 ADCY9O60503 1353 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF4Q96M43 638 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 SYCE3A1L190 88 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 TTC14Q96N46 770 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXD1-201ENST00000331462 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.26■■□□□ 1.95
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HOXD1-201ENST00000331462 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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HOXD1-201ENST00000331462 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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HOXD1-201ENST00000331462 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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HOXD1-201ENST00000331462 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH1L1O75891 902 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 MCM5P33992 734 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 PHF14O94880 888 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 TEFQ10587 303 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 KCNQ3O43525 872 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 C14orf37Q86TY3 774 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD11A6QL63 1104 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 TERF1P54274 439 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLIT3O75094 1523 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 TSPY26PQ9H489 355 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 RASEFQ8IZ41 740 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 KCNB2Q92953 911 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 PXDNQ92626 1479 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL34Q8N239 644 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 AK2P54819 239 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 RUFY3Q7L099 469 aa27.17■■□□□ 1.94
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