RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 IDI1Q13907 227 aa23.09■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 TTC14Q96N46 770 aa23.09■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.09■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A2P04920 1241 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 SPC24Q8NBT2 197 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-201ENST00000329276 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 RAD50Q92878 1312 aa23.08■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.07■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 DLC1Q96QB1 1528 aa23.06■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.06■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.06■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 GNAI3P08754 354 aa23.06■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.05■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 PTGS1P23219 599 aa23.04■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 ALKQ9UM73 1620 aa23.04■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 IGSF3O75054 1194 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 AK2P54819 239 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 ATP8B2P98198 1209 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 TMEM51Q9NW97 253 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K11Q16584 847 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 COG3Q96JB2 828 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 RUFY3Q7L099 469 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP56-201ENST00000329276 SGSM2O43147 1006 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 MTMR6Q9Y217 621 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 TNNT1P13805 278 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 FAM193AP78312 1265 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 ELP1O95163 1332 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 CCDC66A2RUB6 948 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 NME9Q86XW9 330 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 SLFN14P0C7P3 912 aa22.99■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 TYRO3Q06418 890 aa22.99■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 CRB1P82279 1406 aa22.99■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.99■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 KIF18AQ8NI77 898 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 IL25Q9H293 177 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 F6X3S4 739 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 GJB2P29033 226 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 MCM10Q7L590 875 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 KRT222Q8N1A0 295 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 KRT85P78386 507 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 PDE4CQ08493 712 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 G2E3Q7L622 706 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 DRC7Q8IY82 874 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 HYPKQ9NX55 129 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 ZNF75DP51815 510 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 TERF2Q15554 542 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 VPS53Q5VIR6 699 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-201ENST00000329276 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 RAB11FIP3O75154 756 aa22.95■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CAVIN2O95810 425 aa22.95■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 LUZP1Q86V48 1076 aa22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CDC25BP30305 580 aa22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 STK31Q9BXU1 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CBX8Q9HC52 389 aa22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 ITSN1Q15811 1721 aa22.94■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 NEMFO60524 1076 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 LRMPQ12912 555 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 RASEFQ8IZ41 740 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CNTROBQ8N137 903 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 TRIM5Q9C035 493 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 TNMDQ9H2S6 317 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.92■■□□□ 1.26
NOP56-201ENST00000329276 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms