RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 GPT2Q8TD30 523 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 RGS12O14924 1447 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 TCEANC2Q96MN5 208 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 CRB1P82279 1406 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 SBNO1A3KN83 1393 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 FIBPO43427 364 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A6Q13433 755 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 SIRT1Q96EB6 747 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PROSER3Q2NL68 480 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 DLC1Q96QB1 1528 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 MAP3K5Q99683 1374 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PTPRUQ92729 1446 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 AACSQ86V21 672 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CNTROBQ8N137 903 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 ORAI2Q96SN7 254 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 FERMT3Q86UX7 667 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 FOSBP53539 338 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF10O15013 1369 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PPFIA3O75145 1194 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 TBX22Q9Y458 520 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 STK3Q13188 491 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 RASEFQ8IZ41 740 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 NECAB1Q8N987 351 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 IGSF3O75054 1194 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS2-201ENST00000329078 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 AK2P54819 239 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 USP48Q86UV5 1035 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 CBX1P83916 185 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 MCM2P49736 904 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 FSD1Q9BTV5 496 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 SSH3Q8TE77 659 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 DIP2BQ9P265 1576 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 PTH1RQ03431 593 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 VGLL3A8MV65 326 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 GPATCH3Q96I76 525 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 TSPY26PQ9H489 355 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS2-201ENST00000329078 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms