RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 GMNNO75496 209 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF8O76064 485 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MIA2Q96PC5 1412 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MGEA5O60502 916 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 URI1O94763 535 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 KRT85P78386 507 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC43Q8N309 656 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CFTRP13569 1480 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ARAP1Q96P48 1450 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GUL7 405 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TTC14Q96N46 770 aa12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TEFQ10587 303 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MORC4Q8TE76 937 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR63Q8IWG1 891 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TMCO4Q5TGY1 634 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TOP2BQ02880 1626 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP2B1P20020 1258 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 HIP1O00291 1037 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NEK4P51957 841 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NUF2Q9BZD4 464 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD1Q15327 319 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM177BA6PVY3 158 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CTNNA2P26232 953 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 DBN1Q16643 649 aa12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PANK2Q9BZ23 570 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 RUFY3Q7L099 469 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP3K11Q16584 847 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP7Q14244 749 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 BANK1Q8NDB2 785 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC171Q6TFL3 1326 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC150Q8NCX0 1101 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 WASHC4Q2M389 1173 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TMX1Q9H3N1 280 aa12.86□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 SETDB1Q15047 1291 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB9Q96C00 473 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 SPATA32Q96LK8 384 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 AP1ARQ63HQ0 302 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 BICDL2A1A5D9 508 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 FKBP15Q5T1M5 1219 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MTMR7Q9Y216 660 aa12.85□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC114Q96M63 670 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 OPA1O60313 960 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 FERMT1Q9BQL6 677 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MYH7P12883 1935 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 SLU7O95391 586 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 AAMPQ13685 434 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 VCXQ9H320 206 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 GSDMDP57764 484 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 CABP2Q9NPB3 220 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NEMFO60524 1076 aa12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.83□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 JPH4Q96JJ6 628 aa12.83□□□□□ -0.35
HDGFL3-201ENST00000299633 MCM6Q14566 821 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms