RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299155.9

AMN-201, Transcript of amnion associated transmembrane protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMN, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMN-201ENST00000299155 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa32.73■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 PDIA6Q15084 440 aa32.73■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 BECN1Q14457 450 aa32.72■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 SSH3Q8TE77 659 aa32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 ALDH1L1O75891 902 aa32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa32.71■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 APBB1O00213 710 aa32.7■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 CDC45O75419 566 aa32.7■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa32.7■■■□□ 2.83
AMN-201ENST00000299155 TOM1O60784 492 aa32.69■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 OSBPL3Q9H4L5 887 aa32.69■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 CABP4P57796 275 aa32.69■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 MYT1Q01538 1121 aa32.69■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.69■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 IL2RBP14784 551 aa32.68■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 RBM25P49756 843 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 POLA2Q14181 598 aa32.68■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 DDX58O95786 925 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 PIP4K2BP78356 416 aa32.67■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 LRRCC1Q9C099 1032 aa32.67■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.67■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 GLI3P10071 1580 aa32.66■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 SHANK3Q9BYB0 1731 aa32.65■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 SALL3Q9BXA9 1300 aa32.65■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.64■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.64■■■□□ 2.82
AMN-201ENST00000299155 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.63■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.63■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 LINS1Q8NG48 757 aa32.63■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 STRN4Q9NRL3 753 aa32.63■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 PDE1AP54750 535 aa32.62■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 EVA1CP58658 441 aa32.62■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 LAMB4A4D0S4 1761 aa32.61■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 MTX1Q13505 466 aa32.6■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 BCL11AQ9H165 835 aa32.6■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 HDAC5Q9UQL6 1122 aa32.6■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 RAB11FIP3O75154 756 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 SDSP20132 328 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 NBR1Q14596 966 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 USP16Q9Y5T5 823 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 UTYO14607 1347 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 CERKQ8TCT0 537 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32.59■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 UBR2Q8IWV8 1755 aa32.58■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 PAPPAQ13219 1627 aa32.58■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 SRGAP3O43295 1099 aa32.57■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
AMN-201ENST00000299155 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 MYL6BP14649 208 aa32.55■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.55■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.55■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 STAP2Q9UGK3 403 aa32.55■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 COPS6Q7L5N1 327 aa32.54■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.54■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 SURF6O75683 361 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 MX1P20591 662 aa32.53■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 GRM8O00222 908 aa32.53■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 ERBB4Q15303 1308 aa32.52■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 BTG4Q9NY30 223 aa32.52■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 KCPQ6ZWJ8 1503 aa32.52■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 IGKV5-2P06315 115 aa32.51■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa32.51■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 AOX1Q06278 1338 aa32.51■■■□□ 2.8
AMN-201ENST00000299155 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 NEXNQ0ZGT2 675 aa32.5■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 CASC1Q6TDU7 716 aa32.5■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 RHPN1Q8TCX5 695 aa32.49■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 KIF1BPQ96EK5 621 aa32.49■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 TNS2Q63HR2 1409 aa32.49■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.49■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 KIF2CQ99661 725 aa32.48■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 USP35Q9P2H5 1018 aa32.48■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32.48■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 NEURL1BA8MQ27 555 aa32.47■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 SNX21Q969T3 373 aa32.46■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 DISP2A7MBM2 1401 aa32.46■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 SUCLG2Q96I99 432 aa32.45■■■□□ 2.79
AMN-201ENST00000299155 KAZALD1Q96I82 304 aa32.45■■■□□ 2.78
AMN-201ENST00000299155 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa32.45■■■□□ 2.78
AMN-201ENST00000299155 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.44■■■□□ 2.78
AMN-201ENST00000299155 GCKRQ14397 625 aa32.44■■■□□ 2.78
AMN-201ENST00000299155 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
AMN-201ENST00000299155 MYD88Q99836 296 aa32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms