RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 MBD3O95983 291 aa29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 AMPHP49418 695 aa29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 RGS12O14924 1447 aa29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 PDE4CQ08493 712 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 DCTPP1Q9H773 170 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 EYA1Q99502 592 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 SSH2Q76I76 1423 aa29.82■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 CEP85Q6P2H3 762 aa29.81■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 ST18O60284 1047 aa29.8■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 KIF1AQ12756 1690 aa29.79■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP6P59044 892 aa29.79■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 CRB1P82279 1406 aa29.79■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.79■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.78■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 USP31Q70CQ4 1352 aa29.77■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 ATP10DQ9P241 1426 aa29.76■■■□□ 2.36
PKDCC-201ENST00000294964 IGSF3O75054 1194 aa29.75■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 SPTLC3Q9NUV7 552 aa29.75■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 RTL1A6NKG5 1358 aa29.75■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 TTC22Q5TAA0 569 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 USP25Q9UHP3 1055 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 PIK3C2AO00443 1686 aa29.73■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.72■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM51Q9NW97 253 aa29.72■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA0232Q92628 1395 aa29.71■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 FLT4P35916 1363 aa29.7■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.7■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 SLAIN2Q9P270 581 aa29.7■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRCP08575 1304 aa29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 SDSP20132 328 aa29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 ADCY5O95622 1261 aa29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 SBNO1A3KN83 1393 aa29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 BRD1O95696 1058 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 UVSSAQ2YD98 709 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF10O15013 1369 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD7Q92527 254 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 PSME1Q06323 249 aa29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 BRINP3Q76B58 766 aa29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 ABTB2Q8N961 1025 aa29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.66■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.65■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 PHF14O94880 888 aa29.65■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 HOXC9P31274 260 aa29.64■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 TAF3Q5VWG9 929 aa29.64■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 TMX3Q96JJ7 454 aa29.63■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 IL17REQ8NFR9 667 aa29.62■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.62■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 USP54Q70EL1 1684 aa29.62■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.62■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 STK31Q9BXU1 1019 aa29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.6■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 KDRP35968 1356 aa29.6■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 FLIIQ13045 1269 aa29.6■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 PXDNQ92626 1479 aa29.59■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 CASC1Q6TDU7 716 aa29.59■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 CTIFO43310 598 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 NEK4P51957 841 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1524Q8TCG1 905 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 ALS2Q96Q42 1657 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 FEZ1Q99689 392 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.57■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 REC8O95072 547 aa29.57■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 PYCARDQ9ULZ3 195 aa29.56■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 USP48Q86UV5 1035 aa29.56■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms