RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.06■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 POLA2Q14181 598 aa34.05■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.05■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.05■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 PALD1Q9ULE6 856 aa34.05■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 IP6K1Q92551 441 aa34.04■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.03■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.03■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 SLIT3O75094 1523 aa34.03■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 BRD1O95696 1058 aa34.02■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 GPT2Q8TD30 523 aa34.02■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 UNC5CLQ8IV45 518 aa34■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 MBD3O95983 291 aa33.99■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.99■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 SURF6O75683 361 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.98■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 KIF1BPQ96EK5 621 aa33.98■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa33.98■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 RHPN1Q8TCX5 695 aa33.97■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 HSPA4P34932 840 aa33.97■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 DCCP43146 1447 aa33.97■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 TMEM94Q12767 1356 aa33.96■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa33.95■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 MST1RQ04912 1400 aa33.95■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 PI4K2BQ8TCG2 481 aa33.95■■■■□ 3.03
UBP1-201ENST00000283628 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 NUTM1Q86Y26 1132 aa33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 DNAAF4Q8WXU2 420 aa33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 SRGAP3O43295 1099 aa33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 BEND3Q5T5X7 828 aa33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.94■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.93■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 HS1BP3Q53T59 392 aa33.93■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN30Q86W11 494 aa33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 LRSAM1Q6UWE0 723 aa33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 NBPF4Q96M43 638 aa33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 RBSNQ9H1K0 784 aa33.92■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 CHPF2Q9P2E5 772 aa33.91■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 RAD50Q92878 1312 aa33.91■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 GCP02774 474 aa33.91■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 CNTROBQ8N137 903 aa33.91■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 SGSM2O43147 1006 aa33.9■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 TMEM63CQ9P1W3 806 aa33.9■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 LGR6Q9HBX8 967 aa33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 ALS2Q96Q42 1657 aa33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG5O94827 1062 aa33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
UBP1-201ENST00000283628 PI4KAP2A4QPH2 592 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 ATF3P18847 181 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 IL25Q9H293 177 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 NCAPD2Q15021 1401 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 PDLIM2Q96JY6 352 aa33.88■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.87■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 TEFQ10587 303 aa33.87■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 TTC41PQ6P2S7 1318 aa33.87■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 HSPA2P54652 639 aa33.86■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 MTX1Q13505 466 aa33.86■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
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UBP1-201ENST00000283628 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.85■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 ADCY9O60503 1353 aa33.84■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 BTBD11A6QL63 1104 aa33.84■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 CHAMP1Q96JM3 812 aa33.84■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
UBP1-201ENST00000283628 SYCE3A1L190 88 aa33.82■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.82■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 MSNP26038 577 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 SNX14Q9Y5W7 946 aa33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 ALDH1L1O75891 902 aa33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa33.81■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ3O43525 872 aa33.8■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.79■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 TTC14Q96N46 770 aa33.79■■■■□ 3
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