RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 TM4SF1P30408 202 aa16.51■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.51■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.51■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 PCNTO95613 3336 aa16.5■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 SBF1O95248 1867 aa16.5■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 RASSF7Q02833 373 aa16.49■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.48■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.48■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 TTLL6Q8N841 843 aa16.48■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SPC25-201ENST00000282074 H0YIN7 160 aa16.44■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 NFIXQ14938 502 aa16.44■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 NARFQ9UHQ1 456 aa16.44■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 SERPINB2P05120 415 aa16.43■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.43■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.43■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.41■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 CREBZFQ9NS37 354 aa16.41■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 POTECB2RU33 542 aa16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 NFKBIEO00221 500 aa16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.4■□□□□ 0.22
SPC25-201ENST00000282074 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.39■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 CHADLQ6NUI6 762 aa16.39■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.39■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 COL15A1P39059 1388 aa16.39■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 ERFEQ4G0M1 354 aa16.38■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.38■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 TJP1Q07157 1748 aa16.38■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 16.8
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.37■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 PDE6BP35913 854 aa16.37■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 MORC1Q86VD1 984 aa16.37■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.37■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.37■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 A0A087WZG4 1122 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 C21orf2O43822 256 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 SLC39A6Q13433 755 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.36■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 AIDAQ96BJ3 306 aa16.35■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 LGR6Q9HBX8 967 aa16.35■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.35■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.35■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 FOXN1O15353 648 aa16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 STARD3NLO95772 234 aa16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 PANK3Q9H999 370 aa16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SPC25-201ENST00000282074 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.33■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 IL13P35225 146 aa16.32■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 CNTNAP1P78357 1384 aa16.32■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.32■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 SOGA3Q5TF21 947 aa16.31■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 CNKSR1Q969H4 720 aa16.31■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.31■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 NPHP1O15259 732 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 POTEIP0CG38 1075 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 POTEJP0CG39 1038 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 LDHDQ86WU2 507 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.3■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.29■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.29■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 PASKQ96RG2 1323 aa16.28■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 STYK1Q6J9G0 422 aa16.28■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 VEGFBP49765 207 aa16.27■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 SETDB2Q96T68 719 aa16.27■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 MRC1P22897 1456 aa16.27■□□□□ 0.2
SPC25-201ENST00000282074 ST5P78524 1137 aa16.26■□□□□ 0.19
SPC25-201ENST00000282074 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.26■□□□□ 0.19
SPC25-201ENST00000282074 CNBD1Q8NA66 436 aa16.26■□□□□ 0.19
SPC25-201ENST00000282074 MASTLQ96GX5 879 aa16.26■□□□□ 0.19
SPC25-201ENST00000282074 WBP1LQ9NX94 342 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms