RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 CHMLP26374 656 aa10.58□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 SPG7Q9UQ90 795 aa10.58□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 KRT24Q2M2I5 525 aa10.58□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.58□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 SYCE3A1L190 88 aa10.57□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.57□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 FOXO3O43524 673 aa10.56□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 IP6K1Q92551 441 aa10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.56□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.56□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 ITSN1Q15811 1721 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 USP31Q70CQ4 1352 aa10.55□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 STAP2Q9UGK3 403 aa10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 KLHL34Q8N239 644 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 RAD50Q92878 1312 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 UBE2HP62256 183 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.54□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 STX6O43752 255 aa10.54□□□□□ -0.72
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HERC3-201ENST00000264345 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 BICD2Q8TD16 824 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.54□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 KSR2Q6VAB6 950 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 TSPOAP1O95153 1857 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 ATF3P18847 181 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 SSH3Q8TE77 659 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
HERC3-201ENST00000264345 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 CPS1P31327 1500 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 VPS53Q5VIR6 699 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 BECN2A8MW95 431 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-201ENST00000264345 RGS12O14924 1447 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 BRD1O95696 1058 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 TERF1P54274 439 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 PTPRUQ92729 1446 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-201ENST00000264345 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.5□□□□□ -0.73
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