RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.6□□□□□ -1.03
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CSDE1-201ENST00000261443 CHMLP26374 656 aa8.6□□□□□ -1.03
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CSDE1-201ENST00000261443 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.57□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.56□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 GJB2P29033 226 aa8.56□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.56□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 TEX35Q5T0J7 233 aa8.56□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 SKILP12757 684 aa8.55□□□□□ -1.04
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CSDE1-201ENST00000261443 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 TTC14Q96N46 770 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 DACT1Q9NYF0 836 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 KRT85P78386 507 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 DCTN1Q14203 1278 aa8.55□□□□□ -1.04
CSDE1-201ENST00000261443 TTC6Q86TZ1 520 aa8.55□□□□□ -1.04
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