RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SLC39A6Q13433 755 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 ABCA3Q99758 1704 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 CDC45O75419 566 aa24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SSFA2P28290 1259 aa24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 ANXA1P04083 346 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 MEIS3Q99687 375 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 BTG4Q9NY30 223 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.75■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 PIP4K2BP78356 416 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DCAF5Q96JK2 942 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ZNF790Q6PG37 636 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 HOXB7P09629 217 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 IL2RBP14784 551 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 RABEP1Q15276 862 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PROSER3Q2NL68 480 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 TPM2P07951 284 aa24.68■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CABP4P57796 275 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 NUCB2P80303 420 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS2O95450 1211 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CEP85Q6P2H3 762 aa24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CACNA1FO60840 1977 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 AK9Q5TCS8 1911 aa24.64■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ATP10DQ9P241 1426 aa24.64■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TTC22Q5TAA0 569 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MCTP1Q6DN14 999 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ZNF445P59923 1031 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 DCTPP1Q9H773 170 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TOM1O60784 492 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP16Q9Y5T5 823 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP26Q9BXU7 913 aa24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP44Q9H0E7 712 aa24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PDIA6Q15084 440 aa24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MRC1P22897 1456 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MYL6BP14649 208 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CASC1Q6TDU7 716 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 GNAI2P04899 355 aa24.57■■□□□ 1.52
VGF-201ENST00000249330 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.57■■□□□ 1.52
VGF-201ENST00000249330 ADCY9O60503 1353 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.4 ms