RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 VBP1P61758 197 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PPP3R1P63098 170 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 39.3
PDE4D-228ENST00000636120 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RANBP10Q6VN20 620 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SCD5Q86SK9 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PJA1Q8NG27 643 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KCNC2Q96PR1 638 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PHF12Q96QT6 1004 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LGR4Q9BXB1 951 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ITPAQ9BY32 194 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DSN1Q9H410 356 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 POLE3Q9NRF9 147 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 USP3Q9Y6I4 520 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 REM1O75628 298 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 APBB3O95704 486 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DRD2P14416 443 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CASRP41180 1078 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MNDAP41218 407 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GDF5P43026 501 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SCN1BQ07699 218 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GK3PQ14409 553 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRCAPQ14761 206 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL26Q53HC5 615 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DDI2Q5TDH0 399 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HTR3DQ70Z44 454 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf40Q86WS4 652 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KXD1Q9BQD3 176 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0J9YVX5 310 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DAPL1A0PJW8 107 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FANCGO15287 622 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-EP13747 358 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ETS2P15036 469 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CXCR1P25024 350 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GSTM2P28161 218 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TIGD6Q17RP2 521 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PKDCCQ504Y2 493 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KDELC1Q6UW63 502 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAR1Q8WVX9 515 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 STON2Q8WXE9 905 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TOX2Q96NM4 488 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 UPB1Q9UBR1 384 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FAM92AA1XBS5 289 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SOBPA7XYQ1 873 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TTC34A8MYJ7 566 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN25C9JDP6 229 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PREPP48147 710 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TUBA1BP68363 451 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZVL8 140 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TUBA1AQ71U36 451 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ASPGQ86U10 573 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LMX1AQ8TE12 382 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TMCO6Q96DC7 493 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SCRN2Q96FV2 425 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RDH14Q9HBH5 336 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DOCK1Q14185 1865 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB5O75953 348 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 KCNA5P22460 613 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GKP32189 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NPTX1Q15818 432 aa6.25□□□□□ -1.41
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