RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MVJ9	347 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RX6	O15547	441 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRA1	O75019	489 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK14	O94921	469 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFA7	O95182	113 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	BMP4	P12644	408 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CTPS1	P17812	591 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CNR1	P21554	472 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1R2	P27930	398 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ACADSB	P45954	432 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	STC1	P52823	247 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	EVC	P57679	992 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	C21orf58	P58505	322 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A5	P58743	744 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ZP4	Q12836	540 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CA9	Q16790	459 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	AMZ2	Q86W34	360 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ELP5	Q8TE02	316 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	RCHY1	Q96PM5	261 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CYTH2	Q99418	400 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGV	Q9NUD9	493 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	HPF1	Q9NWY4	346 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPG2	P98160	4391 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOC3	O60645	756 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	MTX2	O75431	263 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CYC1	P08574	325 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA5	P08758	320 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA8	P0DM63	369 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP4B1	P13584	511 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOQ	P17081	205 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	TTK	P33981	857 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FLT3	P36888	993 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SLCO1A2	P46721	670 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	DNASE1L1	P49184	302 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	AP1S1	P61966	158 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NFE2L1	Q14494	772 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SFT2D3	Q587I9	215 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ARTN	Q5T4W7	220 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	NLRP14	Q86W24	1093 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51F2	Q8NH61	342 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	STARD4	Q96DR4	205 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ASCL2	Q99929	193 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPH	Q9H3R5	247 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FEZF1	A0PJY2	475 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	CCP110	O43303	1012 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	DTNB	O60941	627 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	LY6G6C	O95867	125 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP2	P08253	660 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SNAP23-223	ENST00000627440	SSR4	P51571	173 aa		5.6	□□□□□ -1.51

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