RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CNR2	P34972	360 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINB10	P48595	397 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSC	P53634	463 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC12A2	P55011	1212 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AQP5	P55064	265 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HIF1A	Q16665	826 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS13	Q6UX07	377 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	VOPP1	Q96AW1	172 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZZEF1	O43149	2961 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JMP0	313 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGAL	P20701	1170 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GMPR	P36959	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAM1	P38567	509 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NPY2R	P49146	381 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXC1	Q12948	553 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF2H3	Q13889	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCL1	Q15111	1095 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ALG11	Q2TAA5	492 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CNST	Q6PJW8	725 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf89	Q6UX73	402 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DPPA4	Q7L190	304 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PARG	Q86W56	976 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10G6	Q8NH81	332 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TFAP2C	Q92754	450 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RTKN	Q9BST9	563 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS44	E7EML9	344 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FZD6	O60353	706 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFS3	O75489	264 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA2	P17301	1181 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPN7	P35236	360 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGCL	P35914	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NBL1	P41271	181 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP5C	P53041	499 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FZD2	Q14332	565 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495		Q3ZCU0	254 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	XKRX	Q6PP77	449 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ARSK	Q6UWY0	536 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	EXT2	Q93063	718 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MARC2	Q969Z3	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIB3	Q96RU7	358 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNA1B	Q00975	2339 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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