RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM38O00635 465 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZW10O43264 779 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR1F1O43749 312 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF4O60810 478 aa16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CDRT15Q96T59 188 aa16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.166e-9■■□□□ 12.1
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.08■□□□□ 0.16
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TRAPPC3-210ENST00000617904 AQP9O43315 295 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP3K7O43318 606 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TGFB1P01137 390 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC3-210ENST00000617904 UCK1Q9HA47 277 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCM8Q9UJA3 840 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHD6Q8TD26 2715 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A088AWK7 358 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 B4DGG1 531 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBP2O00757 339 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANP32DO95626 131 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP6V1G2O95670 118 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGRP06401 933 aa16.06■□□□□ 0.16
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