RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591436.5

TMC6-218, Transcript of transmembrane channel like 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMC6, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6-218ENST00000591436 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 FAR1Q8WVX9 515 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 PEX11GQ96HA9 241 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 SARGQ9BW04 601 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.025e-10■■■□□ 18.5
TMC6-218ENST00000591436 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 SLC5A6Q9Y289 635 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.42■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 NOTCH2Q04721 2471 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 A1L4Q6 167 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 TNFSF10P50591 281 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 PWP1Q13610 501 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 C4orf17Q53FE4 359 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 HAS2Q92819 552 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 VPS39Q96JC1 886 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 C5orf34Q96MH7 638 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 EGFL8Q99944 293 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 DPH5Q9H2P9 285 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 CENPEQ02224 2701 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 UNC79Q9P2D8 2635 aa21.41■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 TRAV17A0A0B4J275 112 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 WDPCPO95876 746 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 AGTR2P50052 363 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 ZNF33BQ06732 778 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 RGS1Q08116 209 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 CALCOCO2Q13137 446 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 BTBD16Q32M84 506 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 ABHD17BQ5VST6 288 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 BCORP1Q8N888 145 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 ANKRD7Q92527 254 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 RHOJQ9H4E5 214 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 PELI2Q9HAT8 420 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.4■■□□□ 1.02
TMC6-218ENST00000591436 FAM187AA6NFU0 413 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 A8MUI8 341 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 E2F3O00716 465 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 PIAS1O75925 651 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 EDN3P14138 238 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ALOX12P18054 663 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 IL10P22301 178 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SCTRP47872 440 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SLC12A2P55011 1212 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SKP1P63208 163 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 REEP5Q00765 189 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 DEFB134Q4QY38 66 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 CEP97Q8IW35 865 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 OR1F2PQ96R84 312 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ERP44Q9BS26 406 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 GPAMQ9HCL2 828 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 OLAHQ9NV23 265 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 OARD1Q9Y530 152 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.39■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 B3GALT4O96024 378 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 LDLRP01130 860 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 AHRP35869 848 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 CDKL1Q00532 357 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 NSDHLQ15738 373 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ABHD13Q7L211 337 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 NT5CQ8TCD5 201 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 RNF32Q9H0A6 362 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 STMN3Q9NZ72 180 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 WHRNQ9P202 907 aa21.38■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 CHST10O43529 356 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SSTR1P30872 391 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 HNF4AP41235 474 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 HNMTP50135 292 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 OLR1P78380 273 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 RHAGQ02094 409 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 CBLBQ13191 982 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 SFT2D3Q587I9 215 aa21.37■■□□□ 1.01
TMC6-218ENST00000591436 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms