RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	BMX	P51813	675 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	IST1	P53990	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FADD	Q13158	208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DOC2A	Q14183	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	E2F2	Q14209	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	UGT8	Q16880	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	IRF7	Q92985	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DOHH	Q9BU89	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TGM5	O43548	720 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SCN2B	O60939	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT75	O95678	551 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	C8A	P07357	584 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	HLA-F	P30511	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDKN2C	P42773	168 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRLHR	P49683	370 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DAP	P51397	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC35A2	P78381	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZXDB	P98169	803 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAPSN	Q13702	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	OXR1	Q8N573	874 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NEDD4L-223	ENST00000588516	B4GAT1	O43505	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	MPZL2	O60487	215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PTPN2	P17706	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRKACG	P22612	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CA8	P35219	290 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	WNT3	P56703	355 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPRL3	Q12980	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAE1	Q13564	534 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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